Vier Jahre nach den Ereignissen des zweiten Teils ist die Menschheit so gut wie geschlagen. Nathan Hale ist tot, und die Chimera kontrollieren den Planeten. Die Geschichte wechselt zu Joseph Capelli, einem ehemaligen Soldaten, der versucht, mit seiner Familie in einer unterirdischen Gemeinschaft zu überleben. Als er die Chance erhält, die Chimera-Invasion endgültig zu stoppen, begibt er sich auf eine düstere, beschwerliche Reise quer durch die zerstörten USA nach New York. Der dritte Teil setzte wieder verstärkt auf eine dreckige Postapokalypse-Atmosphäre und brachte das beliebte Waffenrad des ersten Teils zurück.